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TruSeq小RNA文庫(kù)制備試劑，CRISPR-Cas gRNA

更新時(shí)間：2018-01-09瀏覽：3542次

產(chǎn)品英文名：TruSeq Small RNA Library Prep Kit

產(chǎn)品中文名：TruSeq小RNA文庫(kù)制備試劑盒

 

TruSeq小RNA文庫(kù)制備試劑盒提供用于從總RNA直接生成小RNA文庫(kù)的試劑。試劑盒中附帶的改良接頭能夠靶向通過(guò)Dicer處理產(chǎn)生的MicroRNA (miRNA)。

 

這些試劑盒通過(guò)引入48個(gè)*的標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)多重測(cè)序，借此檢出miRNA和小RNA，并對(duì)通量進(jìn)行圖譜分析，與Illumina測(cè)序無(wú)可企及的輸出相得益彰。標(biāo)簽添加在通用擴(kuò)增反應(yīng)中，從而極大降低了連接偏向性，并確保了miRNA表達(dá)的測(cè)量準(zhǔn)確度。

 

通過(guò)工作流程的改善，樣本制備流程得以精簡(jiǎn)，從而可對(duì)任何物種中的所有小RNA轉(zhuǎn)錄本展開(kāi)經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的研究。兼容的應(yīng)用包括探尋新miRNA、在單堿基分辨率下對(duì)同分異構(gòu)體等變異進(jìn)行特征分析，以及在不進(jìn)行預(yù)先假設(shè)的情況下分析差異表達(dá)。

 

 

品牌

貨號(hào)

產(chǎn)品描述

Illumina

RS-200-0012

TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set A (24 rxns) (Set A: indexes 1-12)

TruSeq小RNA文庫(kù)制備試劑盒 - 套件A（24次反應(yīng)）（套件A：1–12個(gè)標(biāo)簽）

Illumina

RS-200-0024

TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set B (24 rxns) (Set B: indexes 13-24)

TruSeq小RNA文庫(kù)制備試劑盒 - 套件B（24次反應(yīng)）（套件B：13–24個(gè)標(biāo)簽）

Illumina

RS-200-0036

TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set C (24 rxns) (Set C: indexes 25-36)

TruSeq小RNA文庫(kù)制備試劑盒 - 套件C（24次反應(yīng)）（套件C：25–36個(gè)標(biāo)簽）

Illumina

RS-200-0048

TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set D (24 rxns) (Set D: indices 37-48)

TruSeq小RNA文庫(kù)制備試劑盒 - 套件D（24次反應(yīng)）（套件D：37–48個(gè)標(biāo)簽）

Illumina

20005613

TruSeq Small RNA Set A MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents)

TruSeq小RNA套件B MiniSeq試劑盒（1組文庫(kù)制備和2個(gè)MiniSeq試劑）

Illumina

20005614

TruSeq Small RNA Set B MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents)

TruSeq小RNA套件B MiniSeq試劑盒（1組文庫(kù)制備和2個(gè)MiniSeq試劑）

Illumina

20005615

TruSeq Small RNA Set C MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents)

TruSeq小RNA套件C MiniSeq試劑盒（1組文庫(kù)制備和2個(gè)MiniSeq試劑）

Illumina

20005616

TruSeq Small RNA Set D MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents)

TruSeq小RNA套件D MiniSeq試劑盒（1組文庫(kù)制備和2個(gè)MiniSeq試劑）

 

TruSeq小RNA樣本數(shù)據(jù)集

已使用TruSeq小RNA文庫(kù)制備試劑盒制備人類大腦參考RNA (HBRR)和人類通用參考RNA (UHRR)樣本。這些文庫(kù)已使用片段長(zhǎng)度配置為1 x 36堿基對(duì)的MiniSeq高輸出試劑盒在MiniSeq系統(tǒng)上進(jìn)行測(cè)序。總產(chǎn)量為0.91Gb，其中97%的堿基達(dá)到或超過(guò)Q30。

 

Specifications

Assay Time 分析時(shí)間

1 day 1天

Hands-On Time 手動(dòng)操作

4 hours 4小時(shí)

Mechanism of Action 原理

Captures small RNA with 3′ OH and 5′P modifications (like those processed by Dicer/Drosha)捕獲小RNA

Multiplexing

48 unique indexes are available

Species種屬

Any Species, Human, Mouse 任何物種，人，鼠

Specialized Sample Types

特殊樣本類型

FFPE, Low Input

System Compatibility

兼容系統(tǒng)

MiniSeq, MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550

Technology 技術(shù)

Sequencing 測(cè)序

Automation Capability 自動(dòng)能力

Liquid Handling Robots 液體處理機(jī)器人

Variant Class 突變級(jí)別

Novel Transcripts, Transcript Variants

新轉(zhuǎn)錄字，轉(zhuǎn)錄子突變

Method 方法

miRNA and Small RNA Sequencing 

miRNA和RNA測(cè)序

 

特別應(yīng)用推薦：

CRISPR-Cas gRNA 驗(yàn)證

 

Cas9技術(shù)需要：II型 CRISPR–Cas 細(xì)菌免疫系統(tǒng)，包括 trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA), CRISPR RNA (crRNA), Cas9 protein, and protospacer-adjacent motif (PAM)。

 

trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA), CRISPR RNA (crRNA)作用：形成RNA雙鏈，引導(dǎo)Cas9核酸內(nèi)切酶和核酸序列配對(duì)。

Cas9和目標(biāo)PAM序列連接。

 

關(guān)鍵點(diǎn)：guide RNA 和目標(biāo)DNA的互補(bǔ)。

 

大多數(shù)商業(yè)Cas9基因編輯工具來(lái)源：Streptococcus pyogenes（鏈球菌）的II型 CRISPR–Cas 系統(tǒng)。不過(guò)自然界還存在很多具有基因編輯潛力的II型 CRISPR–Cas 系統(tǒng)。開(kāi)發(fā)這種系統(tǒng)需要預(yù)測(cè)驗(yàn)證天然或基因工程來(lái)源的，驅(qū)動(dòng)Cas9的單雙鏈RNA。

因?yàn)閷?dǎo)引RNA的長(zhǎng)度較?。?7-200堿基），適合使用TruSeq小RNA文庫(kù)制備試劑盒（Reads 150nt）進(jìn)行序列驗(yàn)證。

 

參考文獻(xiàn)：

Prediction and Validation of Native and EngineeredCas9 Guide Sequences,Alexandra E. Briner,et al.

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